磁性分離器常見故障有兩個，分別是磨床磁性分離器程序故障和磁性分離器快速啟動系統程序，下面分別說說這兩個故障引起原因和解決方法：
一、磨床磁性分離器故障程序
1、排除故障；
2、按緊急停車按鈕；
3、按重置按鈕；
4、松開緊急停車按鈕；
5、按照啟動程序中步驟4進行操作。
二、磁性分離器快速啟動系統程序
1、打開電源；
2、等待屏幕界面初始化；
3、確保緊急停車按鈕松開；
4、按重置按鈕。當重置程序在運轉的時候，綠色的重置燈就會閃亮，結束后重置燈就不閃（穩定）了。重置的步驟如下：
A、進出口閥打開；
B、液壓泵啟動；
C、氣缸伸出；
D、氣缸伸出時排污口打開，以設定時間；
E、氣缸收回；
F、氣缸收回時排污口打開，以設定時間；
G、系統泵啟動；
H、重設指示器穩定變綠色。
5、轉換手動/自動開關到自動狀態；
6、按循環啟動操作按鈕。啟動進程中綠色運行燈穩定地亮，系統同時正在運行且每次循環之間燈進行閃爍。